
2024年9月由扬州水产业读书张万刚博士生导师精英团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱动物为该研究提供了亚硝基化突显组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
英文版名称:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
中文核心期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2028年影响力分子:5.7
发过周期:2024年9月
消费者组织:南京农业大学
探析板材:蛋白
拜谱展示技木:亚硝基化修饰组学
枝术路径:
一、调查可是
01.Caspase-3亲水性
近些年尚不清NO对caspase-3的克加工用有不能归因于NO介导的S-亚硝基化,与众不同氧化还原电位等度的GSNO对于外源性NO厂家直销,以介导caspase-3的身体外S-亚硝基化。最后得出结论,与不能GSNO的组相信,100、200和400μM GSNO组的caspase-3催化生物更为明显下降(图1),与前者有关资料不一样。GSNO处理下降caspase-3催化生物的存在因素仍有待于说明。
图1 的不同密度的GSNO办理对caspase-3活力性的反应
02.Caspase-3的S-亚硝基化方面
研发Caspase-3的亚硝基化程度高较,以体现了GSNO对Caspase-3的表现性。经GSNO办理后,检验到caspase-3蛋清S-亚硝基化刚度增大(图2)。哪些毕竟呈现,外源性GSNO养育可取得成功成脂caspase-3的休外S-亚硝基化。可笑诧异的是,在还没有GSNO存在着的對照组中检验到两个较弱的S-亚硝基化带,这呈现caspase-3也许 造成内源性的S-亚硝基化。与此同时,本研发中caspase-3的S-亚硝基化程度高较较高,而caspase-3的活性酶类消减,这与前几天的研发不一。但是,caspase-3的特情人S-亚硝基化淡化位点尚不知道,还需要进一次的探究。
图2 GSNO工作对caspase-3S-亚硝基化总体水平的作用
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化绘制组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。紫色符号的字段表现S-亚硝基化肽,灰色符号的C表现S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3化学降解结球蛋白
结蛋清身为一类决定性的体神经元骨架蛋清,在保持肌体神经元节构的节构全面性和缩小性这方面起着决定性功用,钻研S-亚硝基化caspase-3对结蛋清吸附的明理性具备决定性意义所在。与Std(未用胱天蛋清酶-3和GSNO孵育的一开始肌黏胶植物纤维蛋清)组较之,0 μM GSNO组(肌原黏胶植物纤维和caspase-3的孵育,无GSNO)的全面结蛋清含磷量偏态减少,提示信息caspase-3对结蛋清具备潜在性的的蛋清溶解意识。在GSNO孵育后,全面结蛋清的含磷量很大增高(P < 0.05)。虽然,当GSNO浓硫酸浓度增加时,全面结蛋清的含磷量不断地上涨(P < 0.05)(图5)。这一项显示说明,SNO淡化的caspase-3以技术水平依赖感的方式方法促使结蛋清的吸附。
图5.S-亚硝基化caspase-3可降解结蛋白质
05.S-亚硝基化Caspase- 3挥发肌钙蛋白酶-T
肌钙淀粉酶酶质酶-T (TnT)是原肌球淀粉酶酶质酶自动上下调整负责任背部肌肉伸缩的丝条的须得肌原黏胶仟维淀粉酶酶质酶。TnT的分解特殊性是检验到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化前提条件下,caspase-3对TnT的分解症状所显示6所显示,与Std组(含有caspase-3和GSNO的肌原黏胶仟维)相对于,caspase-3组中30 kDa TnT细节描写可观新增,显示caspase-3陆续参与了TnT的分解,与此同时,caspase-3与GSNO的孵育出现30 kDa TnT走低。在100和200 μM GSNO组之前不检验到偏态的差距(P > 0.05),而当GSNO的氨水浓度可达到400 μM 时,该细节描写可观下降(P < 0.05)。以上发展显示了SNO体现的caspase-3对TnT分解的控设计制水平。结淀粉酶酶质酶和TnT是caspase-3的灵敏底物,而GSNO处置有效减轻caspase-3的抗逆性或许出现肌原黏胶仟维淀粉酶酶质酶分解状态有效减轻。提出的提出的,NO诱发的S-亚硝基化可以用体现半胱氨酸残基来自动上下调整caspase-3的抗逆性,以致进一大步干扰其对结淀粉酶酶质酶和TnT的淀粉酶酶质酶溶解水平,因此干扰牛羊肉品味。
图6. S-亚硝基化caspase- 3降解塑料肌钙蛋白酶-T
二、工作小结
本研究分析广泛宣传研究综述S-亚硝基化对caspase-3遮盖语的决定十分其次对鸡肉肌原玻璃食物纤维离体降解塑料的决定。血清S-亚硝基化不错遮盖语caspase-3的半胱氨酸残基,于是造成 caspase-3活性酶类减小,进一大步仰制了其对鸡肉肌原玻璃食物纤维血清的血清油脂水解程度。三、拜谱个人心得体会
论述用于了酶活判断,亚硝基化掩盖组学阐述,WB等查重方式方法,发觉蛋清S-亚硝基化是可以掩盖caspase-3的半胱氨酸残基,这使得了caspase-3活性酶的大幅度降低,并举一歩促使了其对鸡肉肌原植物纤维蛋清的蛋清油脂水解特性。本论述为释疑蛋清质亚硝基化对肉肥的房产调控工作机制提供数据一堆个新的的视角。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的血清质组学、突显血清质组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系列表类产品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺硝化作用、total氧化的恢复、游走巯基,欢迎大家咨询!
可以参考论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663