在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

科研最终结果

1、从光敏激发组织细胞中拆分DNA热塑蛋清质

以便转移光化学热塑核脂肪酸-DNA和好物使用LC-MS定性介绍，小说作家開發好几个种变形纯化手段，可从DNA中去否则化学热塑核脂肪酸，仅在阳光照射时依据同时什么是基因组了解含有DNA化学热塑核脂肪酸。用TRIZOL生成复染质并我们要除执行死刑获的非化学热塑核血清酶，第二将其立即熔化分解以开展RNase肠蠕动不好。依据彩超剪截得到核脂肪酸化学热塑DNA的生成物，在硫氰酸胍中高温变形，并在二钝化硅离心力柱上晕厥清洗以去否则化学热塑核脂肪酸以至达成。依据核酸酶治理 从DNA中发出光化学热塑核血清酶，并开展胰核血清酶酶肠蠕动不好使用LC-MS定性介绍。该手段命名为为核脂肪酸化学热塑DNA生成或XDNAX。

图1.蛋白酶质交连DNA提现或XDNAX步骤图（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可单独碰到DNA的淀粉酶质图谱

将光化学交联方式 选用于MCF7癌体细胞，发觉了1,805种待选球核淀粉酶，其中的1,191种会存在于3个或多次相同中。60%的DNA双方功能组拥有核酸依照的GO引用，在缺泛核酸依照引用的球核高淀粉酶中，上限的业绩来核纤层球核淀粉酶，后者是积极参与上色质组织化和癌体细胞瓦解的球核高淀粉酶（图2）。

图2 . 可单独接受 DNA 的核核苷酸（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3整理了DNA互为帮助组所暗含的蛋清质酶质-DNA介面简答涵盖的核苷酸热塑肽。这包含基于（1）球状DNA紧密配合实际结构的域、（2）DNA 紧密配合实际起居不规律区（IDR）和（3）基于与另外的蛋清质酶质（列如 组蛋清质酶紧密配合实际蛋清质酶）、RNA（列如 剪接因素）或相分开区室（列如 核仁蛋清质酶）互为帮助而会造成的学习环境近乎。

图3 . 可马上打交道 DNA的结构的域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、酶联免疫法细胞膜扰动阶段与DNA融合的转录细胞因子

雌抗生素淀粉酶酶激酶α（ESR1）驻待在胞质溶胶中，等到碰见其配体，引起易位到上皮人体组织质，在哪点它与什么是基因组中的目标板块运用以启用目标的转录软件。将血清饥饿的MCF7上皮人体组织泄露于高摄入量雌抗生素（10 nM 17β-雌二醇）4五分种，与模拟训练清理的比对上皮人体组织有点二者的DNA之间效用组（图4A）。这里面，雌抗生素激励后DNA之间效用组中的ESR1曾加了30倍（图4B）。总的再说，在1,814个参考值的淀粉酶酶质-DNA之间效用中，约有9%屏幕上显示出可超过2倍的重要变动，并检查到与ESR1都具有之间效用的淀粉酶酶如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌皮质激素进行处理乳线癌人体细胞 DNA 双方角色组的参考值较为（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

个人总结

论述开始基因组组组的球蛋清以分析它是该如何被收录并付诸实践性的，一直以来都是教育科研相关人员一款 长期性的的要求。基因组组组可及性基本以DNA为中心站的多角度实行论述，殊不知，到现在到止，染色法质疑胶中的一些球蛋清与DNA 发展热学间接功效尚不了解。使用的零差距光化学交联，可发展DNA间接功效组中的基本都数球蛋清，XDNAX技艺将最为球蛋清-DNA间接功效论述的強大方式。

拜谱工作小结

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的核营养物质组学、绘制组学、消化吸收组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

可以参考学术论文：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.