
近日,南京市医学院校专业一是所属门诊王学浩院土公司在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶向疗法能量转换代谢率检测分析服务。
英语怎么说副标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文字幕文章标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
潜在客户的单位:南京医科大学
研究分析材料:细胞
拜谱能提供服务培训:转录组测序+核蛋白互作组+靶点精力产生组
技术应用的路线:
调查最终
01、YBX1被签定为HCC中糖酵解的重要的dna
本研究阐述录入HCC良性淋巴良性肿癌样品(n=7)的单癌血癌细胞RNA测序资料集开展阐述,显示糖酵解活性酶首要一起在良性淋巴良性肿癌癌血癌细胞中,hdWGCNA阐述甄别出9个dna接口(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的生活阐述知道YBX1为自由生活概率的因素(图1H)。进步骤联系IHC、WB工作和良性淋巴良性肿癌组织机构开展与临近非良性淋巴良性肿癌组织机构开展的环境空间转录组学资料集灵魂存在YBX1是肝癌血癌细胞癌控制的内在靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确认为的调节HCC细胞核糖酵解的要点基本要素
02、YBX1有利于促进HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗能量消耗代谢转化组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1力促HCC中的有氧糖酵解和繁殖
03、OGT与YBX1结合实际并推进YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,核蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1搭配并可以淡化YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增強其磷硝化作用,可以有利于其核转位
进两步检则YBX1的O-GlcNAc糖基化有没不良影响其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC神经元中或用OGT阻止剂OSMI-1加工净化处理,YBX1球核血清级别更为明显消减,YBX1磷硝化作用更为明显可以减少(图4A-C)。IP实验室提示,在完全相同的Flag-YBX1底物级别下,YBX1-WT的磷硝化作用级别更为明显超过YBX1-T57A,揭示磷硝化作用的加剧不但仅是因更高一些的YBX1球核血清展示(图4D)。脱离了核和质混合物看见TMG加工净化处理的HCC神经元中YBX1核展示的变高(图4E-F),进两步看见YBX1磷硝化作用的要点调控分子是AKT(图4G-I)。哪些看见关注O-GlcNAc糖基化利用使得其磷硝化作用来增强学习YBX1球核血清维持性并使得核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 装饰促使于其进十步情况磷过酸装饰并可能使得其核转位
05、YBX1力促PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1有利于促进PKM2转录
06、YBX1 能提高自己组淀粉酶乳酸性反应淡化质量
探究表明YBX1敲低偏态较低了淀粉酶质乳硝凝成用,尤为是H3K18乳硝凝成用(图6A-C)。糖酵解压药物制剂2-DG的實驗查证了糖酵解与组淀粉酶乳硝凝成用的真接连接,压制糖酵解可偏态较低了H3K18la技术水平(图6D)。PKM2过表答可逆性转YBX1敲低所导致的H3K18la上升,之外源乳酸操作不的提升H3K18la,还还会伴有YBX1表答上浮,建议长期存在双向报告(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR查证,H3K18la依据含有于YBX1通电子真接催进其转录,该方式受O-GlcNAc糖基化监测(图6H-J),并表明P300 上浮是YBX1增加H3K18乳酰凝成用的共识机制(图6K-L)。
图6.YBX1提高H3K18乳过酸绘制能力
文章标题总结
在某项钻研中了解了YBX1在HCC中高体现,和与糖酵解迷切有关。YBX1在T57处被O-GlcNAc淡化,为了相对稳定蛋白质酶质并加强其体现。一些淡化还有利于推动YBX1在T57处的磷碱化,有利于推动其核易位。这样,某一历程资料了糖酵解有关dna的转录并促使乳酸的会产生。于此,YBX1促活P300的转录,随之驱动安装组蛋白质酶的乳碱化,特别的是H3K18la,H3K18乳碱化领域国家宏观调控YBX1dna转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观显性基因正负极馈环逻辑图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱怪物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向疗法能量场代谢转化组技术服务,拜谱菌物建立了完善成熟的转录组学、蛋白质组学、全文翻译后修饰语组学、分泌组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
符合文章
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.