草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿软件最先见的胃消化道疾病之六。肾组织机构中CaOx结晶过饱和点积累会造成的肾小管神经元破损和凋亡，为了造成的肾结石的型成。短链脂质酸由胃消化道内活性污泥法大肠杆菌食物发酵合理膳食合成纤维生产，既在部位胃消化道第一道防线中更好地发挥出来功用，又很在软件关卡上也更好地发挥出来核心功用。之中，丁酸是最丰厚的短链脂质酸，都具有抗感染和天然免疫可以抑制功用,本探索论述丁酸对CaOx肾结石的功用基本隐藏靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山大医院泌尿急诊科吴忠专家教授、周子健博士后于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教受、周子健博土在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物技术与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了wifi网络药理学学服务于，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

原创文章英文名称：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 企业客户方：华山医院口腔科 探讨目标：大鼠、HK-2神经细胞 好友分组相关信息：照表组（Con）、模板组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱出示能力：网咯临床药理学测试

工作思路步奏图

调查最终结果

钻研师1实现大鼠仿真模形，确认生物学生化模式标准和组织性病检学着色等钻研途径挖掘丁酸行才能减少CaOx仿真模形大鼠肾CaOx纳米线的养成和问题，调节CaOx仿真模形大鼠的炎症病变问题和硫化有害物质的过头表示。还有，丁酸还可阻止草酸促进的HK-2组织神经元问题、硫化应激性和组织神经元凋亡。 为探究性学习丁酸架构和靶遗传什么是DNA动态数据表格资料网洛，研究方案职工从PubChem抓取丁酸和丁酸酯的二维和三维立体架构（图1A）。利用PharmMapper动态同时在线和Uniprot动态同时在线正确处理后共挑选出117个丁酸靶遗传什么是DNA供进第一步数据表格浅析。将遗传什么是DNA文件列表导入到STRING动态同时在线，做好PPI动态数据表格资料网洛数据表格浅析。Cytoscape根据了顺序排列的前20的交通联络线靶遗传什么是DNA的详细分折动态数据表格资料网洛图，比如CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这样交通联络线遗传什么是DNA与动态数据表格资料网洛中的其余遗传什么是DNA均常见表现出一定程度的想关性，表示这样遗传什么是DNA可以引领着融合功能模块。GO和KEGG数据表格浅析阐释了丁酸交通联络线遗传什么是DNA的想关有效有效途径和生物制品制品学功能模块（图1C）。交通联络线遗传什么是DNA常见与类固醇生长激素类初次回应、阳极氧化的应激状态性初次回应、灵活性酶氧癌细胞对类固醇生长激素类热血的体现还有对酸碱性化学物品物品的体现有关系。总而言之所论，这样交通联络线遗传什么是DNA常见参与进来了阳极氧化的应激状态性和对灵活性酶氧的生物制品制品体现工作，是肾结石建立原则中至关为最重要的有效有效途径，这说明丁酸可以在肾结石中引领为最重要功能模块。

图1| 丁酸架构与靶DNA系统数据分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进步探索世界丁酸对CaOx肾结石真是切靶DNA，学习者回收利用GEO统计资料库对GSE73680中营养较与CaOx肾结石患儿的DNA相护影晌实现了学习。较组与CaOx结石患儿的明显性相护影晌表答DNA（DEGs）淘汰的标准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共淘汰到3783个DNA发生明显改变，里面3379个（89.4%）DNA表答上浮，404个（10.6%）DNA表答降低（图2A）。对DEGs实现聚类算法分析一下分析一下，热图现示了前10个被选中DEGs的二维层次聚类算法分析一下特点（图2B）。随后不久，学习者凭借GeneCards统计资料库手动评定了370个几率与CaOx肾结石关联的DNA，网站排名前20位的预估DNA下列不属于关联性评定下图2C图示。方便找回丁酸诊治CaOx肾结石的核心靶点，学习者将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石关联DNA处置受到新一个Venn图。以后，CYP2C9被肯定为丁酸影晌CaOx肾结石的意向靶点(图2D)。最后，学习者还实现了丁酸与CYP2C9的分子式联接，CYP2C9的三大安基酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸相护使用，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在采取网咯药学学預测CYP2C9是丁酸影晌CaOx肾结石的靶遗传基因后，的研究员工还使用血细胞系试验查证了CYP2C9可减小草酸分析的HK-2血细胞系的ROS标准、宫颈炎症影响和凋亡。

图2| 许多据库协力浅析估计CYP2C9是丁酸目的于CaOx肾结石的靶染色体

探析最终结果

本探究要挖掘丁酸在身体外和体里均能仰制CaOx肾结石对模型的空气钝化应激反应状态和疾病磨损，然后经由数据网站药学学淘汰到丁酸影向CaOx肾结石的自身靶点——CYP2C9，接下来经由生殖细胞膜实验英文查证CYP2C9在草酸盐诱发的HK-2生殖细胞膜ROS标准、疾病磨损和凋亡。等等挖掘证明丁酸可能性经由仰制CYP2C9来仰制CaOx肾结石的空气钝化应激反应状态，缓解疾病磨损。上述进程中拜谱生态学体加快了数据网站药学学枝术贴心服务培训，不但拜谱生态学体可加快成长成熟的的什么是基因组学、血清质组学、分解组学等两组学商品及枝术贴心服务培训，热情接待打电话咨询公司！ 规范资料：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.