代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
大部分认定：产生组学方法也可不不错对中医中的物理大部分完成局面分享，认定出名贵药材中的活力性大部分。列举，再生利用鉴于质谱（MS）的产生组学方法，可不不错认定出红参中的红参皂苷等活力性大部分。各种方法还可不不错区分开入药和非入药大部分的物理标注物，为中医的质理保持提供数据措施。
重量把控：采用消化吸收率组学技能，可对草药的重量实行估评和把控。随后，使用值物消化吸收率组学阐述，可规划设计采取类痛风性骨肩周炎的草药组分的重量标记符号的酶联免疫法手段。除此以外，消化吸收率组学还可鉴别草药中的渗透性组分名词解释渗透性机能，如采用UPLC-Q-TOF-MS科研，区分开不同于乌头值物的药剂学组分，并鉴别有镇痛药灵活性和猛然渗透性的生物体碱。
2. 中药药效机制研究
效应靶点掌握：细胞代谢组学技艺能让掌握中药才活性氧营养成分的原子靶点。举列，调查出现雷公藤红素可在调低Treg/TH1和Treg/Th17平横、阻挡NF-κB信号通路等长效机制挥发免疫抑制效应。
能力考核措施解读：产生组学新技术够阐释药材才进行治疗患病的能力考核措施。诸如，探索发现青蒿素耐药性与疟原虫的线粒体产生改变了有关的的英文，非靶向药物产生组学阐释了与该工作有关的的产生物变换。再者，产生组学还就能够凭借讲解产生物的变换，探索药材才复方的能力考核措施。
3. 中药安全性评价
致毒原则论述：基础分解率组学技术性都可以适用于论述成药的致毒原则。举列，经由基础分解率组学和16S rDNA测序的优势互补分析一下，体现了清益汤对危重症猛然胰腺炎涉及到猛然肺挫裂伤的自我保护原则，并认定了铁沉稳、差异性基础分解率物和微海洋生物菌群左右的有关。
安会性分析考核：基础代谢组学能力还都可以采用中草药的安会性分析考核，辨认不确定的毒副作用化学成分和毒副作用靶点，所以为中草药的安会安全使用可以提供科学技术措施。
4. 中医证候研究
证候相应产生转化物设计：产生转化组学技术性可能中用定量分析与中医医生理论证候相应的内源性产生转化物变换，手游辅助中医医生理论证候的程度和调控。列举，进行产生转化组学设计，已在冠烦扰之处爱美者中鉴别出与痰瘀证随和阴两虚证相应的生物技术标示物。
证候干涉探析：细胞出现组学方法设备还不错使用在探析中药材对中医药学证候的干涉特效。举例，利用细胞出现组学方法设备及聚类算法概述法，遇到“黄芪-茯苓-泽泻”等关联性抗癫痫药剂配选适使用在肾病结合征的新组方抗癫痫药剂，也可以对多种多样肾病结合征涉及的生态学符号物出现决定。
5. 多组学技术整合应用
两组学构建：细胞代谢组学与的组学技艺（如dna组学、转录组学、核苷酸质组学等）的构建APP，为中药才才材探究提供数据了没事个多方面的定性分析的框架。这个构建APP不只是显现了自己对中药才才材的成分在分子结构基本特征上对人体细胞生理方面和病检感觉的损害，又很为呈现中药才才材的帮助体系和药物元素基础条件提供数据了了强感召力的的工貝。
疫情诊治机能：多个学水平能能用在论述中药材诊治疫情的原子机能。如，借助核苷酸质组学和分解组学的联动适用，蕴含了与医学分为的膝骨膝盖骨性骨膝盖炎重视相关的的对比分析表答核苷酸和分解径路。
分泌组学技能在西药科研中的适用，为西药的现今化和脱贫医药可以提供了首要的学科不支持，促进统筹推进西药的条件化和国外化进展。